PCR實驗室工程是生物安全實驗室的一種，是分子生物學研究的基礎和重要手段，主要用于基因突變、基因重組、分子流行病學、動物遺傳育種等領域。其主要特點是操作環境嚴格，實驗材料必須經嚴格消毒處理。它可以在很短時間內得到大量的 DNA分子，并可在體外擴增，具有快速、高效等特點，因而在科研和臨床診斷上得到廣泛應用。
PCR實驗室工程通常分為三部分：實驗室、儀器設備和實驗材料。PCR實驗室工程一般包括四大部分：實驗區域、試劑儲存和準備區、樣品制備區和 PCR擴增區。其中實驗區域主要包括試劑準備區、樣品制備區、擴增反應區和產物分析區；試劑儲存和準備區主要包括試劑儲存區和試劑配制室；樣品制備區主要包括標本制備間；擴增反應區包括 PCR擴增間、反應緩沖液配制間及反應產物分析間。在整個實驗室工程中，儀器設備是為實現實驗目的服務的，因此實驗室的設備一般比較重要，其質量和數量直接影響到實驗結果的準確性。
功能定位
PCR實驗室工程的功能定位，一般分為四個方面：
1、核酸檢測，即核酸的提取、純化、擴增檢測等；
2、基因治療，即基因工程及相關藥物的研究與開發；
3、分子流行病學，即對人群進行基因定位分析研究；
4、生物安全，即對生物進行安全防護研究。對于不同的功能定位，對實驗室工程提出了不同的要求。
建筑設計
1.布局合理，功能齊全，操作方便。實驗室必須與外界有良好的聯系，應采取措施防止外界污染。建筑結構應易于清潔、消毒和維修，室內環境應易于清潔。
2.實驗室內應有足夠的空間進行實驗操作，并盡可能減少操作過程中的干擾。
3.實驗室內應設有人員入口、污物入口，并有必要的通風措施。實驗室應有適當的照明、空調和通風系統。
4.實驗室內應設有適當的應急照明，緊急出口應明顯可見。實驗室內應有足夠的空間進行實驗操作，并應根據實驗要求設置相應的通風系統和機械排風系統，以保證實驗室內的安全和工作環境。
實驗室空調通風系統主要為實驗室內提供恒定的溫度、濕度，保持室內環境的相對穩定，以滿足實驗過程中所需要的空氣質量。根據實驗要求和使用性質，實驗室內往往需要多個相對獨立的區域進行實驗。因此，除了需要保證各個區域獨立控制外，還需要做到每個區域內都要保證有良好的通風換氣效果。實驗室空調通風系統的設計和安裝是一個系統工程，需綜合考慮各種因素，如實驗室面積、溫濕度要求、設備選型等。
凈化系統
PCR實驗室工程中的凈化系統主要是為了保證 PCR擴增過程中所使用的 PCR擴增產物及其他生物樣品具有較高的純度和穩定性。PCR擴增產物和其他生物樣品一般采用高壓蒸汽滅菌的方法進行處理，然后經過洗滌、分裝、儲存、運輸等過程，整個過程都要經過嚴格的凈化處理。PCR擴增產物及其他生物樣品的洗滌、分裝和儲存，均應在生物安全三級實驗室進行，實驗室內部空氣應經嚴格消毒，并達到國家規定的標準。
裝修設計
1.地面采用耐腐蝕、不吸水、易消毒的地面材料。
2.墻面采用防滲漏的耐腐蝕的材料。
5.實驗臺面采用耐腐蝕材料，一般為人造石。
7.實驗室內必須設置吸油煙機，保證室內空氣的清潔和安全。
